首先，我们需要明确一点：甲方卖房给乙方后12年未交付房子，并约定了20万的违约金，这涉及到的是合同违约问题。关于违约金的具体赔偿数额，我们需要从以下几个方面进行分析：

1. 合同约定的违约金数额：

   • 根据题目描述，双方已经明确约定了违约金为20万。在合同有效且双方未对违约金数额提出异议的情况下，这20万就是甲方应当支付给乙方的违约金数额。

2. 违约金的调整可能性：

   • 虽然双方约定了违约金数额，但在某些情况下，法院可能会根据违约情况、损失大小、过错程度等因素对违约金进行调整。例如，如果乙方能够证明因甲方未按时交付房子导致的实际损失远大于20万，那么法院可能会酌情增加违约金的数额。
   • 反之，如果甲方能够证明乙方并未因未交付房子而受到实际损失，或者损失远小于20万，那么法院也可能会酌情减少违约金的数额。

3. 违约金的支付方式：

   • 甲方应当按照合同约定的方式支付违约金。如果合同没有明确约定支付方式，那么双方可以协商确定。一般情况下，违约金应当以货币形式支付，但也可以采取其他双方认可的支付方式。

4. 法律程序：

   • 如果甲方拒绝支付违约金，乙方可以通过法律途径维护自己的权益。例如，乙方可以向法院提起诉讼，要求甲方支付违约金，并承担因违约导致的其他损失。

综上所述，根据题目描述和合同法的相关规定，甲方卖房给乙方后12年未交付房子，应当支付约定的20万违约金。但具体数额可能会根据法院的判断和双方的实际情况进行调整。如果双方对此有争议，建议通过法律途径解决。