保证人对法院调解书的确认的债务，在另案诉讼中一般不可以直接进行抗辩。下面我将从几个角度对此进行详细解释：

1. 调解书的法律效力：

   • 法院调解书一旦经双方当事人签收，即具有与判决书同等的法律效力。这意味着调解书中所确认的债务，对当事人（包括保证人）具有法律约束力。
   • 保证人在调解书中对债务的确认，视为其对债务承担的法律责任，除非有充分证据证明调解书存在违法或可撤销的情形，否则该确认在另案诉讼中不能直接被抗辩。

2. 另案诉讼的独立性：

   • 另案诉讼是一个独立的法律程序，其审理范围和判决依据应基于该案的事实和法律关系。
   • 保证人在另案诉讼中，不能直接以在调解书中已确认的债务为由进行抗辩，因为调解书的法律效力仅及于该调解书所涉及的案件。

3. 抗辩的合法性：

   • 保证人在另案诉讼中若要提出抗辩，必须基于该案的具体事实和法律关系，如债务的真实性、合法性、保证责任的承担范围等。
   • 若保证人试图以调解书中的确认来抗辩另案诉讼中的债务，这可能会被视为滥用抗辩权，不被法院支持。

4. 特殊情况下的抗辩：

   • 在某些特殊情况下，如调解书存在明显错误、违反法律程序或涉及欺诈、胁迫等非法手段，保证人可能有机会在另案诉讼中提出抗辩，要求撤销或变更调解书中的确认。
   • 但这种情况下，保证人需要提供充分的证据来证明调解书存在上述问题，否则其抗辩将不会被法院采纳。

综上所述，保证人对法院调解书的确认的债务，在另案诉讼中一般不可以直接进行抗辩。若保证人认为调解书存在问题或需要提出抗辩，应咨询专业律师（如我），并根据具体情况采取相应的法律措施。