员工因工作原因生病请病假，用人单位扣工资是不合法的。下面我将从几个方面详细解释这一结论：

1. 法定医疗期内的工资支付规定：

   • 根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，企业职工因患病或非因工负伤需要停止工作医疗时，将根据实际参加工作年限和在本单位工作年限给予三个月到二十四个月的医疗期。
   • 在这个医疗期内，用人单位应支付病假工资或疾病救济费，且支付标准不得低于当地最低工资标准的80%。这是法律的底线要求，任何低于此标准的支付都是违法的。

2. 病假工资的计算方法：

   • 病假工资的计算通常基于劳动合同约定的工资标准，但不得低于相应的岗位工资。若劳动合同和集体合同均未约定，则按劳动者本人正常劳动应得的工资确定。
   • 病假工资的系数与职工病假期限及工龄相关，具体标准可能因地区和企业内部规章制度而异，但必须符合法律规定。

3. 扣工资的合法性判断：

   • 企业在员工病假期间扣减工资时，必须确保扣减后的工资不低于法定最低标准，且扣减行为需符合企业内部合法、合理且经过民主程序制定并公示的规章制度。
   • 若企业未经民主程序制定或违反法律规定扣减员工病假期间的工资，或扣减后的工资低于法定最低标准，则构成非法扣减。

4. 特殊情况的考虑：

   • 对于某些特殊行业或岗位，如航空公司飞行员等，可能因工作连续性和重要性的特殊要求而对出勤有更为严格的规定。然而，这些特殊规定同样不能违反法律法规的强制性规定，并且需与员工协商一致或符合行业惯例。

5. 员工权益保护与建议：

   • 若员工认为企业在病假期间扣减工资的行为违法，可通过与公司沟通、向劳动监察部门投诉、申请劳动仲裁或提起诉讼等途径维护自己的合法权益。
   • 在维权过程中，员工应妥善保留病假证明、工资条、劳动合同等相关证据，以证明自己的权益受到侵害。

综上所述，员工因工作原因生病请病假期间，用人单位不得随意扣减其工资。若用人单位违反相关规定，员工有权采取多种措施维护自己的合法权益。如果您在这方面遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。