国家安全罪主要由国家安全机关管辖。国家安全机关负责办理危害国家安全的刑事案件，行使与公安机关相同的职权。这些案件包括但不限于背叛国家、分裂国家、煽动分裂国家、武装叛乱与暴乱、颠覆国家政权、煽动颠覆国家政权、资助危害国家安全犯罪活动等。

具体来说：

1. 立案管辖：危害国家安全犯罪主要由国家安全机关负责立案侦查。国家安全机关具备专业的情报收集、分析和侦查能力，能够有效应对这类犯罪的特殊性和复杂性。对于某些特殊情况，如国家机关工作人员利用职权实施的其他重大犯罪案件，若需要由人民检察院直接受理，必须经省级以上人民检察院决定。

2. 审判管辖：

   • 级别管辖：危害国家安全犯罪案件通常由中级人民法院进行一审，以确保审判的公正性和权威性。
   • 地域管辖：以犯罪地法院管辖为主，包括犯罪行为发生地和犯罪结果发生地的人民法院具有管辖权。如果由被告人居住地的人民法院审判更为适宜，可以由被告人居住地的人民法院管辖。
   • 指定管辖：若需要指定管辖，应当由省、自治区、直辖市的人民检察院和人民法院分别协商决定。

综上所述，国家安全罪主要由国家安全机关进行管辖，从立案到审判都有明确的法律规定和程序。如果您或您身边的人涉及此类问题，请务必及时咨询专业律师，以便得到准确的法律帮助和指导。作为孙乐洋律师，我擅长刑事辩护及相关领域，如有需要，您可以直接向我提问。