针对你提出的“立案申请对方还款，但第三方又欠对方款”的情况，这里是我的处理建议：

1. 明确法律关系：

   • 首先，你需要明确你与对方（债务人）之间的债权债务关系，确保你有充分的证据（如合同、借据、转账记录等）来证明对方欠你款项。
   • 同时，了解第三方与对方（债务人）之间的债权债务关系，确认是否存在有效的债权凭证，以及该债权是否已到期或存在争议。

2. 分别处理：

   • 对你与对方（债务人）的纠纷：如果证据充分，你可以直接向法院提起民事诉讼，要求对方还款。在诉讼过程中，你可以申请财产保全，以确保你的债权得到保障。
   • 对第三方与对方（债务人）的纠纷：这部分纠纷与你与对方的纠纷是两个独立的法律关系。虽然第三方的欠款可能影响对方的还款能力，但你不能直接介入第三方的纠纷。你可以建议对方（债务人）向第三方追讨欠款，或者在对方向你还款后，由对方自行处理与第三方的纠纷。

3. 考虑债权转让或代位权：

   • 如果第三方欠对方的款项数额较大，且对方无力偿还你的债务，你可以考虑与对方协商债权转让，即让对方将其对第三方的债权转让给你，由你直接向第三方追讨。
   • 另外，如果符合法定条件，你也可以行使代位权，即代位对方（债务人）向第三方主张债权，但这需要满足一定的法律条件，并需通过法院诉讼程序来实现。

4. 寻求专业帮助：

   • 在处理这类复杂的债权债务关系时，建议你咨询专业律师，以确保你的权益得到充分保护。我可以为你提供具体的法律分析和诉讼策略建议。

综上所述，你需要先明确各方的法律关系，然后分别处理你与对方、对方与第三方的纠纷。在处理过程中，可以考虑债权转让或代位权等法律手段来维护你的权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。