首先，公司大门被无关人员堵了并发生肢体冲突，这是一个涉及治安管理和可能侵权损害的问题。

1. 立即报警：

   • 在发生肢体冲突的情况下，首要任务是确保人员安全，并立即报警。警方会到场进行调解，并根据情况对涉事人员进行相应的处理。

2. 收集证据：

   • 在冲突发生后，应尽快收集相关证据，包括但不限于现场监控录像、目击者证言、受伤照片等。这些证据对于后续的法律程序可能至关重要。

3. 医疗救治：

   • 如果有人员受伤，应立即送往医院进行救治。同时，保留好医疗记录和相关费用单据，以便后续主张赔偿。

4. 法律评估与咨询：

   • 在冲突解决后，建议咨询专业律师（如我）对事件进行法律评估。律师会根据具体情况，分析可能涉及的法律责任，包括但不限于治安管理处罚、侵权损害赔偿等。

5. 后续处理：

   • 根据律师的评估结果，公司可以决定是否对涉事人员提起民事诉讼，要求赔偿因冲突造成的经济损失和人身伤害。
   • 同时，公司也应加强内部安全管理，防止类似事件再次发生。例如，加强门禁管理、安装监控设备、培训员工应对突发事件等。

6. 注意法律程序：

   • 在整个过程中，应遵守法律程序，不得私自采取报复行为或侵犯他人合法权益。否则，公司可能面临更严重的法律责任。

综上所述，公司大门被无关人员堵了并发生肢体冲突时，应立即报警、收集证据、进行医疗救治，并咨询专业律师进行法律评估与咨询。后续根据律师建议进行相应处理，以确保公司合法权益得到维护。