在交通事故中，当双方被认定为同等责任，并且涉及停运费赔偿的问题时，可以根据以下分析和流程来处理：

一、赔偿原则

根据相关法律法规，特别是《最高人民法院关于审理道路交通事故损害赔偿案件适用法律若干问题的解释》第十二条，若受损车辆为经营性车辆，且因事故无法从事相应经营活动产生了合理的停运损失，当事人是有权请求侵权人按照责任比例来赔偿停运费的。在双方同等责任的情况下，一般各自承担对方停运损失的50%。

二、获得停运费赔偿的条件

1. 车辆性质：必须是依法从事货物运输、旅客运输等经营性活动的车辆，例如出租车、货车、客运大巴等。私家车通常不能主张停运费赔偿。

2. 停运损失的合理性：停运损失应该结合车辆维修时间、正常经营情况下的日均收入等多个因素来综合判断，并且必须提供相关证据来证明停运时间和收入损失。

三、赔偿主张流程

1. 收集证据：

   • 首先要获取交通事故责任认定书，这是确定责任比例的关键文件。
   • 接着要收集车辆维修记录、维修发票，以证明车辆的维修时间和费用。
   • 如果可能，还需要提供运营合同、收入流水、纳税凭证等，以全面证明车辆的运营情况和停运损失金额。

2. 协商赔偿：

   • 在收集到充分的证据后，首先尝试与对方及其保险公司进行协商，明确提出自己的赔偿主张，并展示相关证据。

3. 诉讼解决：

   • 如果协商不成，可以向人民法院提起诉讼，通过法律途径来解决争议。在诉讼过程中，需要向法院提交充分的证据，并由法院根据具体情况进行判决。

四、注意事项

• 在处理停运费赔偿问题时，要注意地区差异和保险公司的具体规定，最好先咨询当地的律师或相关机构，以获取准确的信息和建议。
• 在协商或诉讼过程中，寻求专业的法律帮助是非常重要的，这有助于更好地维护自己的权益，并达成合理的赔偿协议。

综上所述，交通事故中双方负同等责任时，停运费赔偿的问题需要根据法律法规和具体情况来判断。当事人应该充分了解相关的法律知识，积极收集证据，并通过合法的途径来维护自己的权益。