行政协议确认合同无效不受诉讼时效限制。下面我从几个方面详细解释这一结论：

1. 司法论争与最高人民法院表态：

   • 在司法实践中，关于行政协议确认无效是否应受起诉期限限制，一直存在争议。但最高人民法院在相关答复中倾向于认为，提起确认行政行为无效之诉不受起诉期限的限制。这是因为无效行政行为的根本特征是自始无效，不应通过期限被耽误而获得“确定力”。

2. 司法解释的定分止争：

   • 2020年1月1日施行的《最高人民法院关于审理行政协议案件若干问题的规定》间接回应了这一问题。该规定指出，对行政机关变更、解除行政协议等行政行为提起诉讼的，起诉期限依照行政诉讼法及其司法解释确定；而对于行政相对人起诉确认行政协议无效，则应当参照适用《民事诉讼法》关于诉讼时效的规定。《民事诉讼法》关于合同相对人起诉确认合同无效的诉讼时效是无期限限制的，因此行政相对人起诉确认行政协议无效也没有期限限制。

3. 举证责任与审查：

   • 虽然对无效行政协议的起诉不受起诉期限限制，但原告应对被诉行政行为属于无效情形承担举证责任。人民法院在审查时，如果认为属于无效情形，则不受起诉期限限制；如果认为不属于无效情形，应向原告释明，并根据原告的选择继续审理或驳回起诉。

综上所述，行政协议确认合同无效不受诉讼时效限制，但原告需要承担举证责任，证明行政协议存在无效情形。如果您在这方面有具体的法律问题或需要进一步的帮助，请直接向我咨询。