店长利用折扣赚取差价2000元是否违法，取决于具体的行为性质和情境。以下是对此问题的详细分析：

1. 可能构成违法的情况：

   • 如果店长在没有得到公司授权或违反公司规定的情况下，私自利用折扣赚取差价，这可能构成职务侵占或贪污行为，属于违法行为。这种情况下，店长不仅违反了公司的内部管理规定，还可能触犯了刑法中的相关规定。
   • 如果店长通过虚构折扣、伪造交易记录等方式骗取公司财产，同样构成违法，甚至可能构成诈骗犯罪。

2. 不构成违法的情况：

   • 如果店长是在公司允许的范围内，按照公司规定的折扣政策进行销售，并合法地赚取了差价，那么这种行为是合法的。
   • 如果店长是利用自己的个人资源或能力，为公司带来了额外的销售机会，并因此获得了公司给予的奖励或提成，这也是合法的。

处理建议：

• 对于公司而言：如果发现店长存在违法赚取差价的行为，应立即进行内部调查，并视情节轻重给予相应的纪律处分，如警告、罚款、解雇等。同时，公司应完善内部管理制度，加强对员工行为的监督和管理，防止类似行为再次发生。
• 对于店长而言：如果自己的行为确实构成了违法，应主动向公司承认错误，接受公司的处理，并积极配合相关部门的调查。同时，店长也应加强法律意识，遵守法律法规和公司规定，诚信经营。
• 对于消费者而言：如果发现店长存在利用折扣赚取差价的行为，可以向公司投诉或向相关监管部门举报，以维护自己的合法权益和市场秩序。

综上所述，店长利用折扣赚取差价是否违法，需要根据具体行为性质和情境来判断。在处理此类问题时，应综合考虑各方面因素，确保处理结果的公正性和合理性。