公司抵扣了对方发票，并不意味着一定需要承担付款责任，这主要取决于具体的交易情况和法律规定。以下是对这一问题的详细分析：

1. 发票抵扣与付款责任的关系：

   • 发票是交易双方进行结算的凭证，抵扣发票通常意味着买方已经认可了卖方的商品或服务，并在财务上进行了相应的处理。
   • 然而，抵扣发票并不直接等同于承认付款责任。付款责任是基于双方签订的合同或协议，以及实际交付的商品或服务来确定的。

2. 不同情况下的付款责任：

   • 正常交易：如果双方按照合同或协议履行了各自的义务，买方抵扣发票后，通常意味着买方承认了对卖方的付款责任。
   • 存在争议的交易：如果交易过程中存在争议，如商品质量、交付时间等问题，买方可能会抵扣发票但暂不付款，以待争议解决后再行决定。
   • 欺诈或虚假交易：如果交易本身存在欺诈或虚假情况，买方抵扣发票并不构成对付款责任的承认。在这种情况下，买方可能需要通过法律途径来维护自己的权益。

3. 法律建议：

   • 在涉及发票抵扣和付款责任的问题时，建议公司首先审查双方签订的合同或协议，明确各自的权利和义务。
   • 如果存在争议或不确定的情况，建议咨询专业律师进行法律分析和评估，以避免潜在的法律风险。

综上所述，公司抵扣了对方发票并不直接等同于承担付款责任。具体是否需要承担付款责任，还需要根据交易的具体情况和法律规定来判断。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。