科室仪器由科室员工奖金购买，这一行为是否合法，取决于具体的情境和法律规定。以下是从不同角度进行的分析：

1. 财产归属与使用权：

   • 科室仪器通常属于医院的固定资产，其购买和使用应遵循医院的财务管理制度和采购流程。
   • 如果科室员工使用个人奖金购买仪器，需要明确这是否符合医院的财务管理规定，以及员工是否有权使用个人资金为医院购置资产。

2. 法律合规性：

   • 在没有明确违反法律法规的前提下，员工使用奖金购买仪器可能并不直接违法，但可能违反医院内部的管理规定。
   • 需要关注医院是否有相关的规章制度明确禁止或限制员工使用个人资金购买医院资产。

3. 税务与财务处理：

   • 员工使用奖金购买仪器后，涉及的税务处理（如增值税、所得税等）需要符合相关税法规定。
   • 医院在财务上应如何记录这笔交易，以及员工如何证明这笔支出的合理性，都是需要考虑的问题。

4. 潜在风险与后果：

   • 如果员工未经医院同意擅自使用奖金购买仪器，可能会面临医院内部的纪律处分。
   • 在仪器使用过程中，如果发生损坏或事故，责任归属问题可能变得复杂。
   • 此外，员工还需要考虑自己是否有足够的法律知识和能力来处理可能涉及的合同、产权等法律问题。

综上所述，科室仪器由科室员工奖金购买这一行为是否合法，需要综合考虑医院的财务管理制度、法律法规、税务处理以及潜在风险等多个方面。建议员工在购买前咨询医院管理层或专业律师，以确保行为的合法性和合规性。如果你在这方面有具体的法律问题或需要进一步的咨询，可以直接向我提问。