在中标被质疑的情况下，通常应暂停签订政府采购合同。以下是对此问题的详细分析：
法律依据与原则
《政府采购法实施条例》第五十四条明确规定，询问或者质疑事项可能影响中标、成交结果的，采购人应当暂停签订合同，已经签订合同的，应当中止履行合同。这一条款为处理政府采购项目中的质疑提供了明确的法律依据。
《中华人民共和国招标投标法》及其实施条例也有相关规定，强调在招标投标过程中，应确保公平、公正，维护各方当事人的合法权益。因此，当中标结果受到质疑时，暂停签订合同是维护这一原则的重要举措。
实际操作建议
及时响应质疑：采购人在收到质疑函后，应尽快对质疑事项进行审查，并作出响应。如果确信没有问题，可以向质疑方作出合理解释；如果质疑可能成立，则应暂停签订合同，并启动相关纠错程序。
评估质疑影响：采购人应评估质疑事项对中标结果的可能影响。如果质疑事项涉及中标人的资格、投标文件的真实性或完整性等核心问题，且可能影响中标结果，那么暂停签订合同是必要的。
沟通协商：在等待质疑处理期间，采购人可以与中标人保持沟通，解释质疑处理的情况和可能的结果，为后续的合同签订或中止做好准备。
风险防范：如果质疑处理时间较长，或者项目紧急需要推进，采购人可以考虑在采取必要风险防范措施的前提下，经相关部门批准后与中标人签订合同。但这种情况下应特别谨慎，确保不损害其他投标人的合法权益。
综上所述，在政府采购项目中，当中标结果受到质疑时，通常应暂停签订合同，以确保质疑处理的公正性和后续合同的效力。如果质疑处理完毕且中标结果未被改变，采购人可以继续与中标人签订合同；如果质疑成立且影响中标结果，采购人则应按照相关规定进行纠错处理。