在合同纠纷中，如果对方不配合鉴定，举证责任的问题需要根据具体情况来分析。一般来说，举证责任遵循“谁主张，谁举证”的原则。以下是对这一问题的详细解答：
举证责任的一般原则：
- 在合同纠纷中，当事人对自己提出的主张，有责任提供证据加以证明。也就是说，如果你主张对方存在违约行为或合同存在瑕疵，你需要提供相应的证据来支持你的主张。
对方不配合鉴定的影响：
- 如果对方不配合进行鉴定，这可能会对你的举证造成一定的困难。但并不意味着你就无法完成举证责任。
- 你可以尝试通过其他途径来收集证据，比如书面记录、证人证言、视听资料等，以证明你的主张。
法律上的救济途径：
- 如果对方无正当理由拒不配合鉴定，你可以向法院申请强制鉴定。法院有权根据案件的需要，指定鉴定机构进行鉴定，并要求对方配合。
- 如果对方仍然拒绝配合，法院可能会根据已有证据和法律规定，作出不利于对方的判决。
举证责任的转移：
- 在某些特定情况下，举证责任可能会发生转移。比如，如果合同中有明确约定，某一方应当承担特定的举证责任，那么这一方就需要承担相应的举证义务。
- 另外，如果法律或司法解释有特别规定，举证责任也可能发生转移。
综上所述，在合同纠纷中，如果对方不配合鉴定，你仍然有责任提供证据来支持你的主张。你可以通过其他途径来收集证据，并可以向法院申请强制鉴定。同时，你也需要注意举证责任的转移情况，以确保你的权益得到充分保障。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。