承包经营权侵权纠纷不能当作不动产纠纷起诉。下面我将从法律角度详细解释这一结论。

首先，我们需要明确“承包经营权”与“不动产”的法律定义及性质。承包经营权通常指的是对土地、林地等自然资源进行承包并享有经营、收益的权利，它属于一种用益物权，但并非直接针对不动产本身的权利。而不动产，则是指土地、房屋等不能移动或者移动后会损害其价值的财产。

接下来，我们分析两者在法律纠纷处理上的差异。不动产纠纷，如房屋产权纠纷、土地使用权纠纷等，通常涉及不动产的物权归属、转让、租赁等法律问题。而承包经营权侵权纠纷，则主要关注的是承包经营权是否被非法侵害，如被侵占、被非法转让等，它更多地涉及的是承包经营权这一用益物权的保护问题。

因此，从法律性质和法律纠纷处理的角度来看，承包经营权侵权纠纷与不动产纠纷是两种不同的法律纠纷类型，它们分别适用不同的法律规范和诉讼程序。

综上所述，承包经营权侵权纠纷不能当作不动产纠纷起诉。如果你遇到了承包经营权被侵权的问题，建议咨询专业律师，以便更好地维护你的合法权益。作为专业律师，我擅长处理包括承包经营权纠纷在内的各种法律问题，如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我提问。