公司部门独立成立公司，员工是否有赔偿，这主要取决于具体的情况和相关的法律规定。下面我将从几个不同的角度来分析这个问题：
公司重组或分立的情况：
- 如果公司部门独立成立公司是由于公司重组或分立，根据《公司法》的相关规定，员工的劳动合同关系通常会自动转移到新公司，除非员工选择解除劳动合同。在这种情况下，员工一般没有赔偿，因为他们的劳动关系得到了延续。
- 但是，如果重组或分立过程中涉及到了员工的权益损失，比如薪资降低、福利减少等，员工有权要求公司给予相应的补偿。
公司解散或破产的情况：
- 如果公司部门独立成立公司是因为原公司解散或破产，那么员工的劳动合同关系将终止。根据《劳动合同法》，公司应当支付员工经济补偿金，具体数额根据员工在公司的工作年限和月工资来计算。
员工被裁员或解雇的情况：
- 如果公司部门独立成立公司导致员工被裁员或解雇，并且这不是由于员工个人的原因（如绩效不佳、违反公司规定等），那么员工有权要求公司支付经济补偿金或赔偿金。
其他特殊情况：
- 还存在一些特殊情况，比如公司部门独立成立公司是由于业务转让、资产收购等原因。在这些情况下，员工的赔偿问题需要根据具体的合同条款和法律规定来判断。
综上所述，公司部门独立成立公司时员工是否有赔偿，并没有一个统一的答案。它取决于多种因素，包括公司重组或分立的具体原因、员工的劳动合同条款、以及相关的法律规定。因此，如果你或你身边的同事遇到了这样的情况，建议仔细查阅劳动合同和相关的法律法规，或者直接向我咨询，以便更准确地了解自己的权益和可能的赔偿情况。