已经签订协议后，行政机关仍具有补偿安置的职责，但这一职责的履行需基于协议的有效性及约定。以下是对此问题的详细分析：

1. 协议的有效性与履行：

   • 当事人与行政机关签订补偿安置协议后，该协议即成为双方权利义务的依据。若协议内容合法、有效，且行政机关具有签订该协议的法定职责，则行政机关应按照协议约定履行补偿安置职责。
   • 若协议存在无效或可撤销的情形，如行政机关不具备签订协议的法定职责、协议内容违反法律法规等，则当事人可依法请求确认协议无效或撤销协议，并要求行政机关承担相应的法律责任。

2. 申请履行补偿安置职责的处理：

   • 在当事人已经签订补偿安置协议的情况下，若行政机关未按照协议约定履行补偿安置职责，当事人可依法向行政机关提出申请，要求履行协议约定的补偿安置职责。
   • 行政机关在收到申请后，应依法进行审查，并根据协议约定及法律法规的规定，作出是否履行补偿安置职责的决定。

3. 法律救济途径：

   • 若行政机关拒绝履行或未按约定履行补偿安置职责，当事人可依法提起行政诉讼或行政复议，请求法院或复议机关确认行政机关的违法行为，并要求行政机关履行补偿安置职责或承担相应的赔偿责任。

4. 特殊情况的处理：

   • 在某些特殊情况下，如协议签订后法律法规发生变化、协议约定的补偿安置条件发生变更等，可能影响协议的履行。此时，当事人与行政机关应协商处理，或依法通过法律途径解决争议。

综上所述，已经签订协议后，行政机关仍具有补偿安置的职责，但这一职责的履行需基于协议的有效性及约定。若行政机关未按照协议约定履行职责，当事人可依法申请履行，并通过法律途径维护自己的合法权益。如有进一步的法律问题，请直接向我咨询。