企业无权对运输车辆进行法律意义上的罚款。详细分析如下：
一. 企业对内部运输车辆的罚款
内部管理规定：若运输车辆属于企业所有，且企业有合法、合理的内部管理制度，那么企业可以在一定程度上对违规使用或管理车辆的行为进行内部处理，但这种处理并非法律意义上的“罚款”。它更多是基于企业管理需要而设定的一种纪律处分或经济手段，用于督促员工遵守企业规定。
避免混淆：需要注意的是，这种内部处理措施不应与行政机关的罚款行为相混淆。企业内部的处理措施应当明确其性质、目的和程序，并确保其合法性和合理性。
二. 企业对外部运输车辆的罚款
无直接处罚权：对于不属于企业所有的运输车辆，企业无权进行任何形式的法律意义上的罚款。这些车辆与企业之间通常只存在合同关系或业务往来，而不存在行政管理或直接的隶属关系。
合同约束：如果外部运输车辆在执行企业委托的运输任务过程中违反了合同约定，企业可以依据合同约定要求车辆所有人或驾驶人承担违约责任。但这种违约责任的追究并不是罚款，而是基于民事合同关系的一种法律后果。
我建议：企业在处理运输车辆相关问题时，应明确区分内部管理和外部合同关系，确保处理措施的合法性和合理性。对于内部车辆，可以制定合法的内部管理制度进行纪律处分；对于外部车辆，则应通过合同约定的方式明确双方的权利和义务，并在必要时依法追究违约责任。如有进一步需要，您可以继续咨询我。