农民工专用账户的钱由建设单位承担。

详细分析如下：

一. 农民工专用账户的资金来源

根据《保障农民工工资支付条例》及相关规定，农民工工资专用账户是由施工总承包单位在工程建设项目所在地银行业金融机构开立的，专项用于支付农民工工资的专用存款账户。这一账户的资金来源主要是建设单位按照合同约定的拨付周期和比例，按时足额向总包单位专用账户拨付的专项用于支付农民工工资的工程款（即人工费用）。

• 例如，在某工程建设项目中，建设单位与施工总承包单位签订了施工合同，并约定了农民工工资的拨付周期和比例。建设单位需要按照合同约定，将农民工工资款项按时拨付到施工总承包单位开立的农民工工资专用账户中，以确保农民工能够按时足额收到工资。

二. 建设单位承担农民工专用账户资金的责任

建设单位作为工程项目的发包方，有责任确保农民工工资的按时支付。通过设立农民工工资专用账户，并将人工费用从工程款中剥离出来单独规范管理，能够确保人工费用拨付到位，防止与材料费、管理费等资金混同或被挤占，同时防止拖欠工程款和拖欠农民工工资问题互相交织。因此，建设单位承担农民工专用账户资金的责任是明确的。

综上所述，农民工专用账户的钱由建设单位承担，这是根据《保障农民工工资支付条例》及相关规定所明确的。建设单位需要按照合同约定的拨付周期和比例，将农民工工资款项按时拨付到施工总承包单位开立的农民工工资专用账户中，以确保农民工的合法权益得到保障。