即使项目终止了，质疑函也需要回复。具体分析如下：

一. 项目终止不影响质疑答复的义务

• 根据《政府采购质疑和投诉办法》（财政部令第94号）第十三条的规定，采购人、采购代理机构不得拒收质疑供应商在法定质疑期内发出的质疑函，应当在收到质疑函后7个工作日内作出答复，并以书面形式通知质疑供应商和其他有关供应商。这一规定明确了采购人、采购代理机构对质疑函的答复义务，且该义务并不因项目的终止而免除。

二. 项目终止后的质疑处理

• 即使项目已经终止，但如果供应商在法定质疑期内提出了质疑，采购人、采购代理机构仍需按照上述规定进行答复。这是因为质疑函的提出是基于供应商对采购过程或结果的异议，而项目终止并不影响这些异议的存在和合理性。
• 答复质疑函不仅是对供应商权益的尊重，也是采购人、采购代理机构履行法定职责的体现。如果因项目终止而拒绝答复质疑函，可能会引发不必要的法律纠纷和投诉。

综上所述，即使项目终止了，采购人、采购代理机构在收到供应商的质疑函后，仍需按照《政府采购质疑和投诉办法》的规定进行答复。这是法律赋予的义务，也是维护供应商权益、保障采购活动公正性的重要体现。如有进一步需要，您可以继续咨询我。