首先，我们要明确一点，员工偷用公章导致公司被申请执行，这是一个比较严重的问题，涉及到公司的法律责任和内部管理问题。下面，我将从几个角度来分析这个问题，并给出相应的建议。

1. 法律责任分析：

   • 员工偷用公章，如果构成表见代理，公司可能需要承担由此产生的法律责任。表见代理是指行为人虽无权代理，但由于行为人的某些行为，造成足以使善意第三人相信其有代理权的表象，而与善意第三人进行的、由被代理人承担法律后果的代理行为。
   • 如果公司能够证明员工的行为是未经授权的，且公司对此毫不知情，那么公司可能有机会免除或减轻责任。但这需要公司提供充分的证据来证明。

2. 内部管理建议：

   • 公司应立即报警，并配合警方调查，尽可能追回损失。
   • 同时，公司应加强对公章的管理，建立严格的公章使用制度，确保公章的使用必须经过授权和登记。
   • 对于涉事员工，公司应根据内部规章制度进行严肃处理，以儆效尤。

3. 应对执行程序的建议：

   • 如果公司确实被申请执行，应尽快委托专业律师进行应对。律师可以帮助公司分析案情，制定应对策略，并代表公司与执行法院进行沟通。
   • 公司应积极配合执行法院的工作，同时积极寻找证据来证明自己的清白或减轻责任。

4. 预防未来风险的建议：

   • 公司应加强对员工的法律培训，提高员工的法律意识和风险意识。
   • 公司应建立完善的内部风控体系，定期对潜在的法律风险进行排查和评估。

综上所述，员工偷用公章导致公司被申请执行是一个复杂的问题，需要公司从多个角度进行应对。如果你需要更具体的法律建议或帮助，可以随时向我咨询。