在借用设备协议中，主体责任的签字方应当是设备的出借方和借用方，也就是协议中的甲乙双方。通常情况下，这两方都需要在协议上签字或盖章，以确认他们各自的权利和义务。
具体来说：
出借方：作为设备的主人或合法使用者，出借方需要在协议上签字，以确认其同意将设备出借给借用方，并明确出借的条件、期限、费用（如有）以及设备的使用、维护和归还等事项。
借用方：作为设备的使用者，借用方也需要在协议上签字，以确认其接受出借方的条件，并承诺按照协议的规定使用、维护和归还设备。如果借用方是单位，那么通常需要由单位的法定代表人或授权代表签字，并加盖单位公章。
在签字时，双方应当仔细阅读协议内容，确保对各项条款都清楚了解，并自愿接受其约束。如果协议中涉及特殊条款或需要特别说明的事项，双方应当在签字前进行充分沟通，并在协议中明确约定。
总之，借用设备协议的主体责任签字方应当是出借方和借用方双方，他们通过签字或盖章来确认各自的权利和义务，以确保协议的合法性和有效性。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。