土地闲置调查适用自然资源违法行为立案查处工作规程（试行）。

在自然资源管理领域，对于土地闲置的调查与处理，是依据相关法律法规及政策文件进行的。其中，《自然资源违法行为立案查处工作规程（试行）》（以下简称“《规程》”）为土地闲置调查提供了明确的指导和规范。

首先，《规程》明确了自然资源违法行为的立案查处程序，包括线索核查、立案、调查取证、案情分析与调查报告、审理、决定、执行、结案等关键环节。土地闲置作为自然资源违法行为的一种，其调查过程自然应当遵循这一程序。

其次，在土地闲置的调查过程中，需要收集的证据材料包括但不限于：土地权利证明文件、土地利用现状图、土地闲置原因说明、相关当事人的陈述和申辩等。这些证据材料的收集、审查和判断，均应当依据《规程》的相关规定进行。

此外，《规程》还强调了调查过程中的合法性、公正性和程序性。调查人员必须依法依规进行调查，确保调查结果的客观性和准确性。同时，被调查对象也享有陈述、申辩等权利，调查过程应当充分保障其合法权益。

综上所述，土地闲置调查完全适用《自然资源违法行为立案查处工作规程（试行）》。在进行土地闲置调查时，应当严格遵循《规程》的相关规定，确保调查过程的合法性、公正性和程序性，以维护自然资源的合理利用和当事人的合法权益。