工厂请一天假扣三天工资是不合法的。以下是对此问题的详细分析：

法律依据

1. 《中华人民共和国劳动法》第五十条：明确规定工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。
2. 《中华人民共和国劳动法》第九十一条：用人单位克扣或者无故拖欠劳动者工资的，由劳动行政部门责令支付劳动者的工资报酬、经济补偿，并可以责令支付赔偿金。
3. 《工资支付暂行规定》：也强调了用人单位在扣除员工工资时必须合理、合法。

具体分析

1. 工资扣除原则：劳动者为用人单位提供劳动以获取报酬，请假仅是劳动者在特定时间内未能提供劳动。因此，正常情况下，应按照请假的实际时长（如小时或天数）结合劳动者的日工资或小时工资标准进行相应扣除。请假一天扣三天工资显然超出了合理范围，属于不合理的克扣工资行为。
2. 假期类型考虑：无论是事假、病假还是其他类型的假期，用人单位在扣除工资时都应遵循法律法规的规定，不得随意克扣。特别是对于法定节假日、年休假等带薪假期，用人单位应正常支付工资。
3. 公平合理原则：从公平合理的角度出发，任何对劳动者工资的扣除都应基于实际未提供劳动的时间，并进行合理计算。成倍扣除工资的做法违背了这一基本原则。

维权途径

面对工厂不合理扣工资的情况，劳动者可以采取以下措施维护自己的合法权益：

1. 与用人单位协商：首先尝试与用人单位进行沟通，要求其按照正确的工资计算方式支付工资。
2. 向劳动监察部门投诉：若协商无果，可向当地劳动监察部门投诉举报，请求其依法介入处理。
3. 申请劳动仲裁：如果问题仍未得到解决，劳动者可以向劳动仲裁机构申请劳动仲裁，通过法律程序来维护自己的权益。
4. 提起诉讼：对仲裁结果不满意的，劳动者还可以向法院提起诉讼，进一步寻求法律救济。

综上所述，工厂请假一天扣三天工资的做法违反了法律法规，侵犯了劳动者的合法权益。劳动者在面对此类情况时，应依法维权，确保自己的合法权益得到保护。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。