直接离职并不会导致公司扣掉所有没发的工资。下面我详细为你解释一下这个问题：
明确结论
员工直接离职，公司仍然有义务按照员工实际工作的天数和约定的工资标准，及时、足额地支付工资。公司不能因员工直接离职而不发工资或扣掉所有没发的工资。
法律依据与分析
《中华人民共和国劳动法》第五十条明确规定：“工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。”这意味着，只要劳动者提供了正常的劳动，无论其以何种方式离职，用人单位都应当支付工资。
《中华人民共和国劳动合同法》第三十条也强调：“用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。”如果用人单位拖欠或未足额支付劳动报酬，劳动者有权依法向当地人民法院申请支付令。
特殊情况处理
虽然公司不能因员工直接离职而不发工资，但若员工的离职行为给公司造成了经济损失，公司可依据相关法律规定和公司内部规章制度要求员工赔偿。但赔偿损失与支付工资是两个独立的法律关系，公司不能以扣除工资的方式直接抵偿损失。
如果员工与公司签订了竞业限制协议或保密协议，并因其直接离职行为违反了这些协议，公司可根据协议约定要求员工承担违约责任。但这同样不能成为公司拒付工资的理由。
维权途径与建议
如果你遇到公司以直接离职为由拒发工资的情况，可以采取以下措施来维护自己的合法权益：
优先协商：尝试与公司进行友好沟通，明确指出公司扣发工资的行为违反法律规定，要求其尽快支付拖欠的工资。
向劳动监察部门投诉：如果协商无果，你可以向当地劳动监察部门投诉，由其对公司的违法行为进行调查和处理，并责令公司限期支付工资。
申请劳动仲裁：在收集了充分的证据后（如劳动合同、工资条、工作记录、离职通知记录等），你可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求公司支付拖欠的工资及可能的经济补偿。
提起诉讼：如果你对仲裁裁决不服，可以在收到仲裁裁决书之日起的法定期限内向人民法院提起诉讼，通过法律程序来维护自己的合法权益。
综上所述，直接离职并不会导致公司扣掉所有没发的工资。公司应当按照法律规定和你实际工作的天数及约定的工资标准来支付工资。如果遇到公司拒发工资的情况，你可以采取上述措施来维护自己的合法权益。