员工发了离职通知书后，仍然可以申请劳动仲裁。离职通知书的书写与申请劳动仲裁并不冲突，下面我为您详细解释：
一、离职通知书与劳动仲裁的关系
离职通知书是员工向用人单位表达离职意愿的书面文件，而劳动仲裁是员工在认为自身合法权益受到侵害时，向劳动争议仲裁委员会申请裁决的一种方式。两者并不相互排斥，即员工发了离职通知书后，若发现用人单位存在未足额支付工资、未依法缴纳社会保险、违法解除劳动合同等情形，依然有权申请劳动仲裁。
二、可申请劳动仲裁的情形
员工离职后，在以下情形下可以申请劳动仲裁：
- 工资福利问题：如公司未足额支付工资、加班费、奖金等，或未依法为员工缴纳社会保险、公积金，员工可申请仲裁要求公司支付相应款项及补缴社保、公积金。
- 劳动合同解除问题：若公司存在违法解除劳动合同的情形，如无正当理由辞退员工、辞退程序不合法等，员工可申请劳动仲裁，要求公司支付违法解除劳动合同的赔偿金。若员工是因公司未及时足额支付劳动报酬、未依法缴纳社会保险费等而被迫离职，还可要求公司支付经济补偿金。
- 未签订书面劳动合同：若员工入职后公司未在规定时间内与其签订书面劳动合同，员工离职后可就双倍工资差额部分申请仲裁。
- 工伤赔偿问题：员工在工作期间发生工伤，但离职时未获得相应工伤赔偿，或工伤赔偿数额、项目等存在争议，也可申请劳动仲裁。
三、申请劳动仲裁的注意事项
- 仲裁时效：根据《劳动争议调解仲裁法》规定，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。仲裁时效期间从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。劳动关系存续期间因拖欠劳动报酬发生争议的，劳动者申请仲裁不受此仲裁时效期间的限制，但劳动关系终止的，应当自劳动关系终止之日起一年内提出。
- 准备证据：申请劳动仲裁时，员工需准备充分的证据来支持自己的仲裁请求，如劳动合同、工资条、工作证、考勤记录、离职通知书等。这些证据有助于仲裁机构更好地了解案件事实，作出公正裁决。
综上所述，员工发了离职通知书后，若发现自身合法权益受到侵害，完全有权申请劳动仲裁来维护自己的权益。在申请仲裁时，请注意仲裁时效和证据准备等相关事项。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。