针对您提出的关于《中华人民共和国市场主体登记管理条例》与《无证无照经营查处办法》的适用问题，以下是我为您提供的详细解答：

首先，我们需要明确这两部法规的制定目的和主要内容。《无证无照经营查处办法》主要是为了维护社会主义市场经济秩序，促进公平竞争，保护经营者和消费者的合法权益，对无证无照经营行为进行查处。而《中华人民共和国市场主体登记管理条例》则是为了规范市场主体的登记管理，保护市场主体的合法权益，促进社会经济的健康发展。

在处理无照经营违法行为方面，这两部法规确实存在一定的重合。具体来说：

1. 对于不涉及许可证的一般经营活动：

   • 当查处无照经营活动时，《中华人民共和国市场主体登记管理条例》作为新法，应优先适用。这意味着，对于不涉及许可证的无照经营行为，主要依据《市场主体登记管理条例》进行处理。

2. 对于涉及后置许可事项的无证无照经营活动：

   • 应当责令其办理营业执照，并履行双告知义务。即在检查过程中，若发现存在无证经营的情形，市场监管人员应及时抄告许可部门处理，确保经营活动的合法性和规范性。

此外，关于处理涉及许可证的无照经营活动的程序，有两种情形需要注意：

• 一是许可证由市场监督管理局颁发的，可按照《无证无照经营查处办法》的相关规定进行处理。同时，如果涉及到专门法（如特定行业的法律法规），则还需遵循专门法的具体规定。
• 二是许可证不是由市场监督管理部门颁发的，市场监管人员在做好相关检查手续后，应移交颁发许可证的主管机关进行处理，确保各部门之间的协同配合和信息共享。

综上所述，《中华人民共和国市场主体登记管理条例》与《无证无照经营查处办法》在适用上存在一定的互补性。对于不涉及许可证的无照经营行为，优先适用《市场主体登记管理条例》；对于涉及后置许可事项的无证无照经营活动，则需责令办理营业执照并抄告许可部门处理。同时，在处理过程中还需注意各部门之间的协同配合和信息共享，以确保市场经营活动的合法性和规范性。