同事投诉公司，并指出证人是领导指挥让干的，可能会产生多方面的后果。这些后果主要取决于投诉的具体内容、严重程度以及相关法律法规的应用。以下是对可能后果的详细分析：
一. 行政监管措施
调查与核实：如果投诉内容涉及到公司违反劳动保障法律、法规或规章，例如欠薪、超时工作、劳动条件恶劣等问题，劳动保障行政部门会进行调查。如果投诉中提及领导指挥员工从事不当行为，这将是调查的重点之一。
处罚措施：一旦查实公司存在违法行为，根据《劳动保障监察条例》的相关规定，公司可能会面临被责令改正违法行为、警告、罚款等处罚。在严重情况下，公司还可能被责令停业整顿或者吊销营业执照。
二. 法律责任
刑事责任：如果投诉内容涉及到公司或领导人员的严重违法行为，如拒不支付劳动报酬、重大安全责任事故等，根据《中华人民共和国刑法》等相关法律法规，公司及相关责任人员可能会承担刑事责任。
民事责任：如果公司的行为给劳动者造成了损害，无论是否涉及领导指挥，公司都需要承担相应的赔偿责任。根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，公司可能需要支付赔偿金等。
三. 信用记录受损
信用记录的重要性：在现代社会，企业的信用记录对于其经营和发展至关重要。一旦公司因投诉被曝光存在违法行为或不当管理，其信用记录将受到严重影响。
后续影响：信用受损可能会影响到公司的融资能力、合作伙伴关系以及市场竞争力。此外，公司的品牌形象和市场地位也可能因此受到进一步的影响。
四. 社会舆论压力
舆论关注：多人投诉公司往往会引起社会舆论的关注和批评。这种舆论压力可能会对公司的品牌形象和市场地位造成负面影响。
公关挑战：公司需要积极应对舆论压力，采取有效措施恢复公众信任。这可能需要投入大量的人力、物力和财力。
我的观点：对于同事的投诉，公司应给予足够的重视和及时的回应。如果投诉内容属实，公司应积极改正违法行为，承担相应责任，并采取措施防止类似问题再次发生。同时，公司也应加强内部管理，建立健全的规章制度和投诉处理机制，以维护公司的长期稳定发展。如有进一步需要，您可以继续咨询我。