配合异地办行政案件处罚一般由违法行为发生地的行政机关决定。以下是对此结论的详细解释：

1. 法律依据：根据《行政处罚法》以及相关法律法规的规定，行政处罚由违法行为发生地的行政机关管辖。这意味着，如果一个人在异地配合办理了行政案件，但违法行为是在另一地发生的，那么处罚的决定权通常属于违法行为发生地的行政机关。
2. 实际操作：在实际操作中，如果行政机关需要异地配合调查或取证，通常会通过正式的法律程序进行，如发送协助调查函等。一旦证据收集完毕，行政机关会根据收集到的证据以及相关法律法规，对违法行为进行认定，并作出相应的处罚决定。这个决定通常会在违法行为发生地进行，并依据当地的法律法规进行执行。
3. 特殊情况：当然，也存在一些特殊情况。比如，如果违法行为涉及多个地区，或者违法行为人居住地与违法行为发生地不一致，那么行政机关之间可能会进行协商，或者依据相关法律法规的规定，确定由哪个行政机关进行处罚。但总的来说，处罚的决定权仍然倾向于由违法行为发生地的行政机关来行使。

综上所述，配合异地办行政案件处罚一般由违法行为发生地的行政机关决定。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。