工程施工中事实合同关系的法律依据主要来源于《中华人民共和国民法典》（以下简称《民法典》）及相关司法解释、行政法规。以下是详细分析：
《民法典》中的相关规定：
- 合同编通则部分：《民法典》第三编“合同”规定了合同的订立、效力、履行、变更和转让、终止、违约责任等基本规则，这些规则同样适用于建筑施工合同。例如，合同双方应遵循平等、自愿、公平和诚实信用原则；依法成立的合同对当事人具有法律约束力。
- 建设工程合同专章规定：《民法典》第十八章“建设工程合同”（第七百八十八条至第七百九十九条）针对施工合同作出特别规定，明确承包人资质要求，强调按图施工义务，规范竣工验收程序，并建立价款优先受偿权制度等。
相关司法解释：
- 如《最高人民法院关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释》等司法解释，针对建设工程施工合同纠纷中的法律适用问题作出了详细规定，包括合同效力的认定、工程价款的结算方法、利息支付、工程质量争议及实际施工人权益保护等难点问题，为法院正确审理相关案件提供了统一的法律依据。
行政法规与部门规章：
- 如《中华人民共和国建筑法》系统规范建筑工程发包与承包活动，明确强制招标范围、分包限制条件、质量保修责任等。
- 《建设工程质量管理条例》强化质量管控措施，包括施工许可制度、质量监督程序、质量事故处理机制等。
在工程施工中，事实合同关系虽然可能未以书面形式明确，但根据《民法典》及相关法律法规，只要双方实际履行了合同义务，且该履行行为符合法律法规的强制性规定，即可视为形成了事实合同关系。此时，双方应遵循《民法典》中关于合同履行的相关规定，诚信履行各自义务，并承担相应的法律责任。
综上所述，工程施工中事实合同关系的法律依据是一个多层次、多维度的法律体系，主要由《民法典》及相关司法解释、行政法规构成。在签订和履行合同时，必须严格遵守这些法律规定，确保合同的合法性、有效性和规范性，从而维护合同双方的合法权益，促进建筑市场的健康发展。如有任何具体法律问题或疑问，请直接向我咨询。