关于事业单位人员嫖娼处罚两年后单位是否会知道的问题，结论并不是绝对的，这取决于多个因素。

1. 从法律程序的角度看：嫖娼行为属于违法行为，一旦被发现并查处，会经过一系列的法律程序，包括调查、取证、处罚等。如果这一过程中，相关部门（如公安机关）严格遵循了法律程序，并且没有将处罚信息主动通报给事业单位，那么两年后单位可能不会直接知道该员工的嫖娼处罚情况。

2. 从单位管理的角度看：事业单位对于员工的管理通常有一定的制度和规定，包括员工的品行、纪律等方面。如果单位有明确的制度要求员工报告个人的违法犯罪情况，或者单位在员工入职、晋升等环节会进行相关的背景调查，那么有可能在调查过程中发现员工的嫖娼处罚记录。此外，如果员工在处罚后因为某种原因（如需要开具无违法犯罪记录证明等）主动向单位透露了处罚情况，单位也会因此知晓。

3. 从信息泄露的角度看：虽然法律程序上可能保证了处罚信息的保密性，但在实际操作中，信息泄露的风险总是存在的。比如，相关部门的工作人员可能因工作疏忽或不当行为导致信息泄露，或者员工本人在处罚后因为某种原因（如炫耀、报复等）主动将处罚情况告知他人，这些都可能导致单位最终知晓员工的嫖娼处罚情况。

综上所述，事业单位人员嫖娼处罚两年后单位是否会知道，取决于多个因素的综合作用。因此，无法给出一个绝对的结论。如果你对此类问题有进一步的疑问或需要更具体的法律建议，可以直接向我咨询。