关于您提出的“二人公司全部股东签订转让协议，其中一人违约，是二人付对方违约金还是一人付”的问题，我的回答如下：
结论：在二人公司中，如果全部股东签订了转让协议，并且其中一人违约，那么通常是由违约的那一方单独向守约方支付违约金，而不是由两人共同支付。
分析说明：
合同相对性原则：根据合同法的基本原则，合同是当事人之间的法律约束，只对合同当事人具有法律效力。在二人公司股东签订的转让协议中，如果一方违约，那么该违约方应依据协议中的约定，向守约方承担违约责任，包括支付违约金。
违约责任的独立性：每个股东在协议中的权利和义务是独立的。一人违约，并不意味着其他非违约股东也需要承担违约责任。除非协议中有特别约定，否则非违约股东无需为违约股东的违约行为承担责任。
协议条款的审查：当然，具体违约金的支付方式和责任承担还需要根据转让协议的具体条款来确定。如果协议中有特别约定，比如连带责任、共同责任等，那么就需要按照协议的约定来执行。但如果没有特别约定，那么通常就是由违约方单独承担责任。
综上所述，在二人公司股东签订的转让协议中，如果一方违约，通常是由违约方单独向守约方支付违约金。如果您对协议的具体条款有疑问，或者需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。