当对方注销了营业执照且仲裁不受理时，你仍可通过确认注销合法性、向相关责任主体主张权利、起诉等途径来维护自己的合法权益。以下是我为你详细分析的建议：
一. 了解注销情况并尝试其他维权途径
确认注销的合法性：首先，你需要了解对方注销营业执照的具体情况，包括注销程序是否合法。如果发现注销程序存在问题，你可以向相关部门反映并寻求纠正。
向相关责任主体主张权利：
- 如果对方在注销前存在未履行的债务或义务，且你与其有明确的合同关系，你可以尝试向对方的清算组织或相关责任人主张权利。
- 通过工商行政管理部门查询企业注销后的相关信息，如清算报告、股东信息等，以确定具体的责任主体。
二. 涉及债权的处理
- 如果你的权益涉及债权，如货款、服务费等，你需要在法定期限内向对方的清算组织或相关责任人申报债权，并参与企业的清算分配。
三. 起诉的可行性及具体操作
确定被告主体：
- 如果对方在注销过程中存在过错，如未依法清算、虚假清算等，且这些行为损害了你的利益，你可以将对方的股东、发起人、出资人或清算组等作为被告提起诉讼。
准备起诉材料：
- 起草起诉状，明确写明原告和被告的基本信息、诉讼请求以及事实和理由。
- 收集相关证据材料，如合同、发票、付款记录、对方注销登记材料等，以支持你的诉讼请求。
选择管辖法院：
- 一般遵循“原告就被告”的原则，由被告住所地的人民法院管辖。
- 如果合同中有明确约定管辖法院，且该约定不违反法律规定，你也可以按照约定向法院起诉。
注意起诉时效：
- 你需要在收到仲裁不予受理通知书之日起15日内向有管辖权的人民法院提起诉讼，以免超过诉讼时效。
应对被告的抗辩：
- 在诉讼过程中，被告可能会提出各种抗辩理由。你需要针对这些抗辩进行充分的反驳和举证，以维护自己的合法权益。
四. 特殊情况的处理
- 如果对方在注销前存在未结清的争议，且你已经提前申请了仲裁，但仲裁机构因对方注销而不予受理，你可以尝试向相关部门反映情况，并请求他们协助处理。
五. 相关法律依据
- 根据《中华人民共和国民法典》第七十条，法人解散的，除合并或者分立的情形外，清算义务人应当及时组成清算组进行清算。清算义务人未及时履行清算义务，造成损害的，应当承担民事责任。
- 根据《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国公司法〉若干问题的规定（二）》第十九条，有限责任公司的股东、股份有限公司的董事和控股股东，以及公司的实际控制人在公司解散后恶意处置公司财产或未经依法清算给债权人造成损失时，应承担相应的赔偿责任。
综上所述，即使对方注销了营业执照且仲裁不受理你的申请，你仍有多种途径可以维护自己的合法权益。我建议你根据具体情况选择合适的维权方式，并及时采取行动。如有进一步需要，你可以继续咨询我。