如果在劳动仲裁过程中对方公司注销了，处理起来会比较复杂，但您依然有多种途径来维护自己的权益。以下是具体的分析和建议：

1. 明确注销情况与责任主体：

   • 首先，您需要尽快了解公司注销的具体原因、是否存在清算主体，以及清算过程中是否处理了员工的劳动权益等问题。
   • 如果公司未经依法清算即办理注销登记，您可以主张由有限责任公司的股东、股份有限公司的董事和控股股东，以及公司的实际控制人对劳动仲裁确定的债务承担清偿责任。
   • 如果公司是个体工商户，营业执照注销后，经营者仍应承担责任。

2. 根据仲裁阶段采取不同措施：

   • 仲裁过程中公司注销：您可以向仲裁委说明情况，申请变更仲裁主体，由有限责任公司的股东等作为当事人参加仲裁。
   • 仲裁裁决已作出，执行阶段公司注销：您可以申请追加上述责任主体为被执行人，要求其对公司债务承担清偿责任。

3. 收集证据，保障权益：

   • 无论处于哪个阶段，您都需要及时收集与公司注销、劳动争议相关的证据，如注销登记申请书、清算报告、劳动合同、工资单、工作记录等。
   • 这些证据将对您后续维权起到至关重要的作用。

4. 法律途径维权：

   • 如果公司注销后，您无法通过仲裁或执行程序获得应有的赔偿，您可以考虑向法院提起诉讼，要求相关责任主体承担法律责任。
   • 在诉讼过程中，您需要提供充分的证据证明自己的主张，并依据相关法律法规进行论证和辩护。

综上所述，虽然对方公司注销会给劳动仲裁带来一定的困难，但您依然可以通过明确注销情况与责任主体、根据仲裁阶段采取不同措施、收集证据以及通过法律途径维权等方式来维护自己的合法权益。如果您在这个过程中遇到任何法律问题或需要进一步的帮助，请随时向我咨询。