关于您提出的“补充协议重新确认付款时间如何确认纳税义务发生时间”的问题，这确实是一个涉及税务处理的细致问题。以下是对此问题的详细解答：

首先，我们需要明确纳税义务发生时间的基本原则，它通常与收入的实现或款项的收取紧密相关。在税务实践中，纳税义务的发生时间往往根据具体的交易方式和结算方式来确定。

对于您提到的补充协议重新确认付款时间的情况，我们可以从以下几个方面来分析纳税义务的发生时间：

1. 合同或协议条款：

   • 补充协议作为原合同的补充或修改，其关于付款时间的约定应当被视为合同的一部分。
   • 如果补充协议明确规定了新的付款时间，并且这一时间与原合同中的付款时间不同，那么纳税义务的发生时间通常应当按照新的付款时间来确定。

2. 交易实质和结算方式：

   • 纳税义务的发生时间还可能受到交易实质和结算方式的影响。
   • 例如，如果交易是采用托收承付结算方式，那么纳税义务通常发生在收到货款的当天或办妥委托银行收款的当天。
   • 如果交易是服务性质的，并且服务已经提供完毕，那么纳税义务可能发生在服务提供完毕并收到款项（或按照合同约定应当收到款项）的当天。

3. 税法规定：

   • 在处理税务问题时，必须严格遵守税法规定。
   • 如果税法对某一类交易的纳税义务发生时间有特别规定，那么应当遵循这些规定。

综上所述，补充协议重新确认付款时间后，纳税义务的发生时间应当根据新的付款时间、交易的实质和结算方式以及税法规定来综合确定。在实际操作中，建议您咨询专业的税务顾问或税务机关，以确保您的税务处理符合法律法规的要求，并避免潜在的税务风险。