员工去仲裁公司不算自动离职。下面我将从几个方面详细解释这个问题：

1. 自动离职的定义：

   • 自动离职是劳动者未依法定程序私自离岗的擅自行为。它通常指的是员工在没有经过正当程序（如提前通知、申请辞职等）的情况下，自行离开工作岗位。

2. 劳动仲裁的性质：

   • 劳动仲裁是解决劳动纠纷的法定途径，当劳动者与用人单位之间发生劳动争议时，劳动者可以通过劳动仲裁来维护自己的合法权益。
   • 劳动仲裁的启动并不意味着劳动关系的自动解除，它只是开启了争议解决的法律程序。

3. 劳动仲裁与自动离职的关系：

   • 劳动者因劳动仲裁暂未到岗，如果遵循了仲裁程序且有合理理由，通常不被视为自动离职。
   • 劳动者在申请劳动仲裁期间，仍然需要遵守用人单位的考勤等规章制度，如果无故长时间不上班，且未向用人单位说明情况，用人单位有可能以旷工等理由认定其自动离职。

4. 法律建议：

   • 劳动者在申请劳动仲裁前，应尽可能与用人单位沟通，说明自己申请仲裁的意图和理由，以避免不必要的误解和纠纷。
   • 如果劳动者在仲裁期间需要暂时离开工作岗位，应提前向用人单位请假或说明情况，以确保自己的行为符合用人单位的规章制度。

综上所述，员工去仲裁公司并不构成自动离职。劳动仲裁是劳动者维护自己合法权益的法定途径，与自动离职没有直接关系。劳动者在申请劳动仲裁期间，应遵守用人单位的规章制度，确保自己的行为合法合规。