使用假毕业证办理药品许可证，将会面临严重的法律后果，包括但不限于行政处罚和可能的刑事责任。下面我将从法律角度进行详细分析：

一. 行政处罚

1. 依据：根据《中华人民共和国药品管理法》及相关行政法规，使用虚假材料申请药品许可证是违法行为。
2. 后果：一旦查实，药品监督管理部门将撤销已颁发的药品许可证，并对申请人进行行政处罚，如罚款、没收违法所得等。同时，申请人还可能被禁止在一定期限内再次申请药品许可证。

二. 刑事责任

1. 依据：如果使用假毕业证的行为构成伪造、变造、买卖国家机关公文、证件、印章罪，或者诈骗等犯罪，将依据《中华人民共和国刑法》追究刑事责任。
2. 后果：根据犯罪情节和严重程度，申请人可能面临有期徒刑、拘役、管制、罚金等刑罚。

三. 其他影响

• 使用假毕业证办理药品许可证不仅会影响个人的声誉和信用，还可能对药品市场的秩序和公众健康造成潜在威胁。
• 一旦被查处，申请人的相关信息可能会被公开，对其未来的职业发展和社会生活产生负面影响。

我建议：申请人应严格遵守法律法规，使用真实、有效的材料申请药品许可证。如有任何疑问或需要法律帮助，应及时咨询专业律师，以避免不必要的法律风险。同时，药品监督管理部门也应加强监管，严厉打击使用虚假材料申请药品许可证的违法行为。