司法鉴定意见在某些情形下是不能作为证据使用的，这些情形主要包括：
鉴定机构或鉴定人不具备资格：
- 鉴定机构不具备法定的资格和条件，或者鉴定事项超出本鉴定机构项目范围或者鉴定能力的。
- 鉴定人不具备法定的资格和条件，如不具有相关专业技术或者职称，或者违反回避规定。
鉴定程序、方法有错误：
- 鉴定过程中存在程序错误，如未按照规定的程序进行鉴定。
- 鉴定方法不科学、不合理，导致鉴定结论不可靠。
鉴定意见与证明对象无关联：
- 鉴定意见与案件中的证明对象没有直接关联，无法起到证明作用。
鉴定对象与送检材料、样本不一致：
- 鉴定对象与送检的材料、样本不一致，导致鉴定结论无法反映真实情况。
送检材料、样本来源不明或污染：
- 送检材料、样本来源不明，或者确实被污染且不具备鉴定条件，使得鉴定无法得出准确结论。
违反鉴定特定标准：
- 鉴定过程中违反了相关的鉴定特定标准，导致鉴定结论不符合规定要求。
鉴定文书缺少签名、盖章：
- 鉴定文书缺少鉴定人或鉴定机构的签名、盖章，使得鉴定结论的合法性受到质疑。
其他违反规定的情形：
- 其他任何违反相关法律法规或鉴定规定的情形，都可能导致鉴定意见不能作为证据使用。
综上所述，司法鉴定意见在作为证据使用时，必须确保其合法性、科学性和关联性。如果鉴定意见存在上述任何一种情形，那么它就不能作为定案的根据。在诉讼过程中，当事人有权对鉴定意见提出异议，并要求重新鉴定或补充鉴定。如果您对司法鉴定意见有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。