对于自然资源罚没的建筑物，处理方式主要包括拆除、没收并依法管理和处置等，具体取决于建筑物是否符合规划以及相关法律法规的规定。

一. 符合规划的建筑物处理

• 若建筑物符合城乡规划（国土空间规划）、环境保护、产业发展、消防及建筑质量安全等相关规定，接收单位可以决定予以保留，并拟定补办农转用或征收手续的计划。经有批准权的人民政府批准后，由自然资源主管部门依法通过划拨、出让等方式供地。
• 例如，某违法建筑物经评估符合所有相关规定，政府可以决定保留该建筑物，并为其补办合法的土地使用手续。

二. 不符合规划的建筑物处理

• 若建筑物不符合上述相关规定，如违反城乡规划或建筑质量安全标准，则应当予以拆除。拆除工作由接收单位组织，并将土地交还原集体经济组织耕种。
• 例如，若一违法建筑物位于规划中的绿地范围内，且无法调整规划以适应该建筑物，则该建筑物将被拆除。

三. 特殊情况下的处理

• 对于短期内难以完善用地手续且不宜立即拆除的建筑物，接收单位可以安排临时使用。此时，相关土地占用费由接收单位确定的实际占用人与被占地农民集体经济组织协商进行支付。
• 例如，某违法建筑物虽然不符合规划，但拆除会对其周边居民生活造成严重影响，政府可以决定暂时保留该建筑物作为临时使用，同时支付土地占用费给原集体经济组织。

四. 法律依据

• 根据《中华人民共和国土地管理法》及相关实施条例，县级以上人民政府自然资源主管部门对非法转让或者非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施有权作出拆除或者没收的处罚决定。
• 没收的建筑物应依法管理和处置，具体方式由本级人民政府或其指定的部门决定。

我建议，在处理自然资源罚没建筑物时，应严格遵循相关法律法规的规定，确保处理方式的合法性和合理性。同时，也应考虑社会公共利益和资源的合理利用。如有进一步需要，您可以继续咨询我。