关于双方对付款时间有争议时诉讼时效的计算，这是一个涉及合同法和诉讼时效法律规定的复杂问题。以下是对此问题的详细解答：

首先，结论是：诉讼时效的起算点通常依赖于合同约定的付款时间或双方实际履行的付款时间，但在存在争议的情况下，需要具体分析合同条款、交易习惯以及相关法律法规来确定。

1. 合同约定明确：

   • 如果合同中明确约定了付款时间，且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么诉讼时效一般从合同约定的付款时间届满之日起计算。
   • 如果合同中有关于诉讼时效的特别约定，如约定了更长的诉讼时效期间或特殊的起算点，那么应按照合同约定执行，但需注意该约定不得违反法律对诉讼时效的最长保护期限。

2. 合同约定不明确或存在争议：

   • 当合同对付款时间约定不明确，或者双方对付款时间存在争议时，需要依据交易习惯、行业惯例或相关法律法规来确定付款时间。
   • 在这种情况下，诉讼时效的起算点可能会更加复杂，可能需要通过诉讼或仲裁程序由法院或仲裁机构来裁定具体的付款时间和诉讼时效起算点。

3. 实际履行与合同约定不符：

   • 如果双方在实际履行过程中改变了合同约定的付款时间，且这种改变是双方真实意思的表示，那么诉讼时效应从实际履行的付款时间起算。
   • 但如果这种改变是单方面行为，且未得到对方的认可，那么仍应按照原合同约定的付款时间来计算诉讼时效。

4. 注意诉讼时效的中断和中止：

   • 在诉讼时效期间内，如果发生法定事由导致诉讼时效中断（如债权人提起诉讼、债务人同意履行义务等），则诉讼时效重新计算。
   • 如果发生法定事由导致诉讼时效中止（如不可抗力等），则诉讼时效在事由消除后继续计算。

综上所述，双方对付款时间有争议时诉讼时效的计算是一个复杂的问题，需要根据具体情况进行具体分析。如果你在这方面有具体的法律问题或需要进一步的帮助，请随时向我咨询。