专业合作社已注销，一般应以清算组或清算负责人为被告。具体分析如下：

一. 合作社注销后的诉讼主体

1. 清算组或清算负责人为被告：根据《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国民事诉讼法〉的解释》第六十四条，“企业法人解散的，依法清算并注销前，以该企业法人为当事人；未依法清算即被注销的，以该企业法人的股东、发起人或者出资人为当事人”。专业合作社作为特别法人，在注销后，如其已依法进行清算，则应以清算组或清算负责人为被告。
2. 特殊情况下的被告确定：若专业合作社未依法清算即被注销，那么应以该专业合作社的股东、发起人或者出资人为被告。

二. 实际操作中的考虑

• 在实际操作中，确定被告时需要查询专业合作社的注销情况，包括是否进行了清算，以及清算组或清算负责人的信息。这通常可以通过工商登记部门或相关法院进行查询。
• 如果专业合作社注销后存在遗留的债务或纠纷，清算组或清算负责人需要承担起相应的法律责任，因此他们作为被告是合理的。

我建议，在提起诉讼前，务必查清楚专业合作社的注销情况及清算情况，以便准确确定被告，确保诉讼的顺利进行。如有进一步需要，您可以继续咨询我。