申请材料造假，系主任不可以批准。以下是对此结论的详细解释：

1. 法律与道德层面：

   • 申请材料造假是违法行为，可能涉及伪造、变造公文、证件、印章等犯罪。无论在任何情况下，造假行为都是不被法律所容忍的。
   • 从道德层面来看，造假违背了诚信原则，损害了社会公平和正义。系主任作为教育机构的管理者，更应坚守道德底线，不能批准任何造假行为。

2. 教育机构的职责：

   • 教育机构的首要职责是培养人才，而人才的培养需要建立在真实、公正的基础上。系主任作为教育机构的重要管理者，有责任维护这一基础，确保教育过程的公正性和真实性。
   • 如果系主任批准了申请材料造假，不仅违反了教育机构的职责，也会对学生产生极大的负面影响，损害教育机构的声誉和公信力。

3. 可能的后果：

   • 如果申请材料造假被揭露，涉事者将面临严重的法律后果，包括但不限于刑事处罚、行政处罚等。
   • 对于教育机构而言，也将面临严重的声誉损失和可能的法律责任。系主任作为直接责任人，将承担相应的责任。

综上所述，申请材料造假是严重的违法行为，系主任不能批准任何形式的造假行为。如果面临申请材料的问题或困难，应寻求合法、合规的途径解决，而不是通过造假来逃避问题。