行政单位能直接申请软件著作权。

根据《计算机软件保护条例》的相关规定，软件著作权属于软件开发者，其中“软件开发者”包括实际组织开发、直接进行开发，并对开发完成的软件承担责任的法人或者其他组织。行政单位作为法人组织，在满足一定条件下，完全有资格申请并享有软件著作权。

具体来说，行政单位申请软件著作权需要满足以下条件：

1. 独立开发：行政单位需证明其对软件进行了独立的开发工作，包括组织团队、投入资源、实施开发等各个环节。

2. 承担责任：行政单位需对开发完成的软件承担全面的责任，包括软件的质量、功能、安全性及可能涉及的侵权问题。

3. 独创性与可复制性：申请的软件作品需具备独创性，并能以某种有形形式复制，如存储在磁盘、光盘等介质上。

在申请软件著作权时，行政单位需要准备以下材料：

• 填写完整的计算机软件著作权登记申请表；
• 提供软件和文档的鉴别材料，通常包括源程序的前、后各连续的30页（若整个程序不足60页，则需提交全部）以及用户手册、设计说明书、使用说明书等相关文档的前、后各连续的30页（若文档不足60页，也需提交全部）；
• 提供行政单位的营业执照副本复印件等证明文件，以证实其主体资格。

申请流程一般包括：

1. 准备材料：确保申请材料真实、完整、准确。

2. 提交申请：可通过线上或线下方式将申请材料提交至中国版权保护中心。

3. 受理与审查：中国版权保护中心将对申请进行受理和审查，可能会要求补充材料或进行进一步说明。

4. 登记发证：经审查符合规定的，中国版权保护中心将予以登记，并颁发计算机软件著作权登记证书。

综上所述，行政单位作为法人组织，在满足相关条件的前提下，完全有权申请软件著作权，并通过提交完整的申请材料、遵循规范的申请流程，最终获得著作权行政管理部门颁发的软件著作权登记证书，从而享有对该软件作品的著作权保护。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。