在职期间是可以申请软件著作权的。以下从不同角度为你详细分析：

从法律角度

根据我国《计算机软件保护条例》等相关法律法规，软件著作权的申请主体并没有对申请人的职业状态进行限制。也就是说，无论你是在职人员、自由职业者还是学生等，只要你是软件的开发者或者通过合法途径获得了软件的相关权利，都有资格申请软件著作权。

从实际操作角度

1. 个人名义申请：如果你在职期间开发的软件是利用业余时间，且没有使用公司的资源（如设备、技术资料等），那么你可以以个人名义申请软件著作权。在这种情况下，软件著作权归你个人所有，与公司无关。但需要注意的是，要确保在开发过程中没有违反与公司签订的劳动合同、保密协议等相关约定，避免因申请软件著作权而引发与公司之间的纠纷。
2. 公司名义申请：如果软件是在工作时间内，利用公司的资源开发的，那么软件著作权通常归公司所有。在这种情况下，公司会以自己的名义申请软件著作权。不过，有些公司可能会与员工在劳动合同或相关协议中约定，对于员工在工作期间开发的软件，公司给予员工一定的奖励或权益分配。
3. 合作开发申请：如果软件是你与公司或其他个人合作开发的，那么申请软件著作权时需要明确各方的权利和义务。一般来说，合作开发的软件著作权由合作开发者共同享有，申请时需要各方协商一致，并按照约定的比例或方式分配著作权。

从可能存在的风险角度

1. 与公司产生纠纷：如果在没有明确约定的情况下，你以个人名义申请了在职期间利用公司资源开发的软件的著作权，公司可能会认为你侵犯了公司的权益，从而引发法律纠纷。因此，在申请软件著作权之前，最好与公司进行沟通，明确软件著作权的归属问题。
2. 违反劳动合同或协议：有些劳动合同或协议中可能会对员工在职期间开发软件的著作权归属进行约定。如果你违反了这些约定，可能会面临违约责任，甚至可能会被公司辞退。

法律建议

1. 查看劳动合同和相关协议：在申请软件著作权之前，仔细查看你与公司签订的劳动合同、保密协议、知识产权协议等相关文件，明确其中对于软件著作权归属的约定。
2. 与公司沟通协商：如果对软件著作权的归属存在疑问，或者你希望以个人名义申请软件著作权，最好与公司进行沟通协商，争取达成一个双方都能接受的解决方案。
3. 保留相关证据：在开发软件的过程中，要注意保留相关的证据，如开发记录、源代码、设计文档等，以备在发生纠纷时能够证明自己的权利。

如果你在职期间有申请软件著作权的需求，或者对软件著作权的相关问题还有疑问，可以直接向我咨询。