若因公司经营不善关掉分公司，员工拒绝到总公司上班并选择离职，一般情况下员工是无法获得赔偿的。具体分析如下：

一. 分公司关闭与员工离职的关系

1. 分公司关闭：公司经营不善导致分公司关闭，是公司基于经营需要的正常调整。
2. 员工选择：员工有权选择是否接受到总公司上班的安排。若员工不愿意，可以选择离职。

二. 离职赔偿的法律依据

1. 无赔偿依据：根据《劳动合同法》的相关规定，员工因个人原因主动离职，如不愿意接受工作地点变更等，并不构成公司需要支付经济补偿金的法定情形。
2. 特殊情况：但如果公司关闭分公司且未提供合理的替代工作安排，或者存在其他违法解除或终止劳动合同的情况，员工则有权要求经济补偿。

三. 结论分析

• 在本案例中，员工因个人原因（不愿意到总公司上班）选择离职，并不属于公司违法解除或终止劳动合同的情形。
• 因此，员工一般无法获得经济补偿或赔偿。

综上所述，因公司经营不善关掉分公司，员工拒绝到总公司上班并选择离职，通常是没有赔偿的。这是基于员工个人选择离职，并不符合获得经济补偿的法定条件。如有进一步需要，您可以继续咨询我。