公司之间的往来款抵扣个人借款，在一般情况下并不合法。具体分析如下：

1. 公司法人独立性：

   • 公司是具有独立法人资格的主体，其财产和债务与公司股东、法定代表人或其他个人是分离的。
   • 公司的往来款，即公司之间的交易款项，属于公司的财产，不能随意与个人借款相抵扣。

2. 债权债务关系明确性：

   • 公司之间的往来款和公司或个人之间的借款，是两种不同性质的债权债务关系。
   • 往来款通常基于商业交易产生，而个人借款则是基于个人之间的借贷合意。
   • 两者在法律上需要分别处理，不能混为一谈。

3. 法律合规性：

   • 如果公司试图将往来款抵扣个人借款，可能会涉及财务造假、逃避债务等违法行为。
   • 这种行为可能会损害公司债权人的利益，破坏市场交易的公平性和诚信原则。

4. 例外情况：

   • 在某些特殊情况下，如果公司和个人之间存在明确的债权债务转让协议，并且符合相关法律法规的规定，那么往来款可能会以某种方式与个人借款相关联。
   • 但这种情况下，也需要确保所有相关手续和文件都是合法、有效的，并且经过了相关监管机构的批准或备案。

综上所述，公司之间的往来款抵扣个人借款在一般情况下并不合法。公司和个人应该分别处理各自的债权债务关系，遵守相关法律法规和商业道德。如果有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。