运政部门有权对骨架板拉集装箱的违规行为进行罚款。以下是对此问题的详细分析：
一. 运政部门的执法权
运政部门，即交通运输管理部门，在交通运输领域具有广泛的执法权。根据《中华人民共和国道路运输条例》等相关法律法规，运政部门有权对违反交通运输规定的行为进行处罚，包括罚款。
二. 骨架板拉集装箱的合规性要求
骨架板是专门用于运输集装箱的挂车类型。根据相关规定，骨架板拉集装箱必须满足一定的合规性要求，如：
- 集装箱的标准性：运输的集装箱必须为市场上的标准型集装箱，尺寸要符合规定，不能为自制箱。如果集装箱的尺寸超标，如超长、超宽、超高，则可能构成违规行为。
- 车辆的改装限制：骨架板只能用于运输集装箱，不能私自改装成其他车型。如果车主私自加装底板、上装、仓栅或栏板等，将骨架板改装成其他类型的挂车，则违反了相关法律法规。
三. 违规行为的法律责任
如果骨架板拉集装箱的行为违反了上述合规性要求，运政部门有权根据相关法律法规进行处罚。具体的法律责任可能包括：
- 罚款：根据违规情节的轻重，运政部门可以对车主处以一定金额的罚款。
- 责令改正：运政部门可以要求车主立即停止违规行为，并采取措施进行改正。
- 其他处罚措施：在严重违规的情况下，运政部门还可能采取扣车、吊销经营许可证件等更严厉的处罚措施。
四. 实际案例与风险提示
- 实际案例：在某些地区，已经出现了骨架板拉超长、超宽、超高集装箱被运政部门查处的案例。这些违规行为不仅导致了罚款等法律后果，还可能对道路交通安全构成严重威胁。
- 风险提示：对于车主而言，应当严格遵守相关法律法规和合规性要求，确保骨架板拉集装箱的行为合法合规。否则，一旦被发现违规行为，将面临严厉的法律制裁和经济损失。
我的观点：运政部门有权对骨架板拉集装箱的违规行为进行罚款等处罚措施。车主应当提高法律意识，严格遵守相关规定，确保运输活动的合法性和安全性。如有进一步需要，您可以继续咨询我。