您好，关于您提出的“协议盖章和发票盖章不一致”的问题，这里给您一个清晰、详细且深度的解答。

首先，合同章（或协议章）和发票章在用途上是有所区别的。合同章主要用于签订各类合同，以明确合同双方的权利和义务，它代表了合同订立的意愿和双方达成一致的表示。而发票章则专门用于开具发票，以证明发票的合法性和有效性，它更多地与税务相关业务相关联。

其次，在实际经营过程中，企业可能根据业务需求刻制多个合同章或不同用途的印章。这是为了满足企业日常运营中多样化的需求，只要这些印章的刻制和使用符合法律法规以及企业内部规定，就是合法合规的。

因此，合同章和发票章无需保持一致。它们各自有其独特的用途和法律意义，只要依法依规刻制和使用，就能确保业务的合法性和规范性。在您所描述的情况中，如果协议上加盖的是合同章，而发票上加盖的是发票章，且两者均符合法律法规和企业内部规定，那么这种不一致并不会影响合同的效力或发票的合法性。

综上所述，您不必因为协议盖章和发票盖章不一致而担心合同的效力或发票的合法性。只要确保各自印章的合法性和合规性，就可以放心地进行业务往来。希望这个解答能够帮到您，如果还有其他问题，欢迎随时咨询。