公司扣押证书，员工可以要求赔偿。针对这一问题，我们可以从以下几个方面进行分析：

一. 公司扣押证书的法律性质

1. 侵犯员工财产权：证书作为员工的个人财产，受到法律的保护。公司无故扣押员工的证书，实际上是对员工财产权的侵犯。
2. 可能影响员工就业：证书往往与员工的职业技能和资格紧密相关，被扣押后可能影响员工的就业和职业发展。

二. 赔偿的法律依据

1. 《中华人民共和国民法典》的相关规定：根据民法典关于物权保护的规定，任何组织或者个人不得非法扣押他人的财产。公司扣押员工证书，违反了这一规定，员工有权要求返还并请求赔偿损失。
2. 《中华人民共和国劳动法》的相关规定：虽然劳动法未直接规定公司扣押证书需赔偿，但劳动法保护员工的合法权益，包括与劳动相关的各种权益。公司扣押证书影响员工就业，可视为对员工权益的侵害，员工有权要求赔偿。

三. 赔偿的具体实现

1. 协商赔偿：员工可首先与公司进行协商，要求公司返还证书并赔偿因扣押证书造成的损失，如误工费、精神损失费等。
2. 法律途径：若协商无果，员工可向法院提起诉讼，要求公司承担相应的法律责任，包括赔偿损失。

综上所述，公司扣押员工证书是违法的，员工有权要求公司返还证书并赔偿因此造成的损失。我建议员工在遭遇此类情况时，首先尝试与公司协商解决；若协商不成，应及时寻求法律途径维护自己的合法权益。如有进一步需要，您可以继续咨询我。