针对您提出的“商铺有问题租赁合同有效吗”这一问题，首先我需要明确的是，商铺租赁合同的有效性取决于多个因素，特别是商铺本身的合法性以及合同内容的合规性。以下是我对这一问题的详细分析：
商铺的合法性对合同效力的影响：
- 如果商铺是违章搭建的，即未取得建设工程规划许可证或者未按照建设工程规划许可证的规定建设，那么根据《最高人民法院关于审理城镇房屋租赁合同纠纷案件具体应用法律若干问题的解释》第二条，出租人就此类房屋与承租人订立的租赁合同无效。这意味着，如果商铺存在问题，如违章搭建，那么租赁合同在法律上是无效的。
- 然而，也存在例外情况。如果在一审法庭辩论终结前，违章搭建的商铺取得了建设工程规划许可证或经主管部门批准建设，那么原本可能无效的租赁合同将被认定为有效。
合同内容的合规性对合同效力的影响：
- 除了商铺的合法性外，合同内容本身也需要符合法律法规的强制性规定，不能违背公序良俗。合同双方需要具备相应的民事行为能力，且意思表示必须真实。只有满足这些条件，合同才能被视为有效。
- 如果合同中存在欺诈、胁迫等导致合同无效的情形，那么即使商铺本身合法，合同也是无效的。
综上所述，商铺有问题时租赁合同的效力取决于商铺的合法性以及合同内容的合规性。如果商铺是违章搭建的，那么租赁合同通常无效。但如果商铺在一审法庭辩论终结前取得了合法的建设手续，或者合同内容本身存在无效情形，那么合同的效力将受到相应影响。
因此，在签订商铺租赁合同前，建议双方务必仔细审查商铺的合法性和相关证件是否齐全，以及合同内容是否合规，以避免后续可能出现的法律纠纷。如果您在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。