个人所得税退税选择单独计税是合法的。以下是具体的分析：

一. 法律依据

• 根据《中华人民共和国个人所得税法》及其实施条例，纳税人可以选择单独计税或综合计税的方式。单独计税是针对特定项目（如年终奖、股权激励等）单独计算税额，不与综合所得合并计税。

二. 单独计税的合法性

1. 选择权：纳税人根据个人情况和税收政策，有权选择对自己更有利的计税方式。如果单独计税能降低税负，那么选择这种方式是合理的，也是法律允许的。
2. 政策依据：税收政策中明确规定了单独计税的适用范围和计算方式，纳税人按照政策规定选择单独计税，是符合法律要求的。

三. 实际操作

• 在实际操作中，纳税人在申报个人所得税时，可以根据税务部门提供的申报系统或指引，选择单独计税或综合计税。如果选择单独计税，需要按照政策规定提供相关证明材料，并确保计算的准确性。

四. 建议

• 我建议纳税人在选择计税方式时，应充分了解税收政策，结合自身实际情况进行权衡。如果条件允许，可以咨询税务专业人士或利用税务部门的咨询服务，以确保选择的计税方式既合法又合理。

综上所述，个人所得税退税选择单独计税是合法的，但需要在政策规定的范围内进行，并确保计算的准确性。如有进一步需要，您可以继续咨询我。